ветеринария

Исследование посвящено разработке экономически эффективного метода оценки инбридинга у домашних собак с помощью ультранизкого покрытия полногеномного секвенирования (ulcWGS). Авторы предложили альтернативу дорогостоящему секвенированию с высоким или средним покрытием, что критически важно для популяционной и сельскохозяйственной генетики. В ходе работы был сконструирован многопородный референсный панель на основе образцов с высоким покрытием, после чего проводилась оценка инбридинга в независимых образцах ulcWGS через анализ участков гомозиготности (RoH) и коэффициентов инбридинга (F). С помощью нелинейной регрессии была смоделирована зависимость между этими показателями и глубиной секвенирования. Результаты подтвердили значительную корреляцию между относительными измерениями RoH и F, при этом у чистокровных собак было зафиксировано больше участков гомозиготности и более высокие коэффициенты инбридинга по сравнению со смешанными породами. Данный метод позволяет значительно снизить стоимость генетического мониторинга, делая его более доступным для широкого круга исследователей и селекционеров.