В исследовании представлен новый биоинформатический инструмент multiScaleAC, предназначенный для анализа пространственной транскриптомики и изучения взаимодействия клеток в опухолевом микроокружении. Авторы решают проблему предвзятости при выборе фиксированного радиуса взаимодействия, предлагая использовать расширенный индекс Морана с применением гауссова ядра и варьируемой шириной полосы пропускания (h). Методология позволяет анализировать взаимодействия на различных пространственных масштабах, используя функциональный анализ данных. В ходе симуляций метод продемонстрировал высокую статистическую мощность: показатель 1.00 при полосах пропускания более 5 для истинных взаимодействий. При тестировании на 8 образцах ткани толстой кишки (Visium) инструмент выявил профили лиганд-рецепторных взаимодействий с точностью 73.7%–87.2% по сравнению с методом spatialDM. Применение метода к данным по почечно-клеточной карциноме показало, что показатели функционального компонента 1 коррелируют с воздействием иммунотерапии: в стромальных тканях, подвергшихся лечению, наблюдался значительно более высокий уровень взаимодействий COL4A1-ITGAV. Это делает multiScaleAC важным инструментом для более точного понимания архитектуры тканей и ответа на терапию.