В статье представлен fastCDS — высокопроизводительный инструментарий на языке C++, предназначенный для быстрого сопоставления областей белков с геномными координатами на основе GTF-аннотаций. Основная проблема существующих методов заключается в низкой масштабируемости при проведении полнопротеомного анализа, в то время как fastCDS обеспечивает скорость работы на два-три порядка выше конкурентов. Инструмент предоставляет интерфейсы командной строки и Python, позволяя за считанные секунды сопоставить все домены Pfam человека с их геномным расположением. Авторы использовали полученный атлас для исследования того, как архитектура экзонов варьируется в зависимости от функций доменов. Данная разработка критически важна для интерпретации клинических вариантов в контексте экзонов и изучения структуры экзонов. Инструментарий доступен по лицензии MIT и может быть легко интегрирован в биоинформатические конвейеры через pip или mamba.