Исследователи представили Spaceland — инновационный программный фреймворк, предназначенный для создания непрерывных 3D-молекулярных ландшафтов целых органов. Метод решает критическую проблему компромисса между плотностью выборки и точностью реконструкции в пространственной транскриптомике. Spaceland использует морфологически-информированное пространство, объединяя разреженные данные транскриптомики с серийными гистологическими срезами (H&E), обработанными с помощью моделей-оснований (foundation models). Алгоритм строит плотный 3D-морфологический каркас через интерполяцию оптического потока, что позволяет декодировать экспрессию генов на сетку с разрешением 8 мкм. Тестирование на обонятельной луковице и полушарии мозга мыши показало, что Spaceland успешно преодолевает молекулярные разрывы до 400 мкм и превосходит существующие методы интерполяции ST и 2D-прогнозирования. В экспериментах на регенерации планарий система позволила проводить анализ всего организма по четырем срезам Visium на стадию, выявляя динамическую пространственную перестройку нейронов. Технология открывает путь к созданию масштабируемых виртуальных моделей тканей и органов для изучения прогрессирования заболеваний и ответа на лекарственную терапию.