В статье представлен inquiSTR — новый специализированный программный инструментарий командной строки, предназначенный для высокоскоростного генотипирования длины тандемных повторов по всему геному. Тандемные повторы являются высокоизменяемыми элементами генома, которые играют ключевую роль в развитии различных человеческих заболеваний и формировании признаков. Разработчики внедрили в inquiSTR алгоритмы потоковой обработки с низким потреблением памяти и эффективную параллелизацию, что позволило достичь рекордной скорости: обработка каталога из 1,78 миллиона локусов занимает менее двух минут. Бенчмаркинг подтвердил высокую точность метода и значительное превосходство в производительности над существующими аналогами и эталонными наборами данных (truth sets). Помимо генотипирования, инструмент включает функционал для последующего биоинформатического анализа, включая определение популяционной структуры, проведение тестов на ассоциацию и поиск генетических аутлайеров. Данная разработка имеет высокую значимость для популяционной генетики и персонализированной медицины, ускоряя анализ данных полногеномного секвенирования длинными прочтениями.