Представлен SMART (Somatic Mutation Annotation and Reporting Tool) — специализированный Docker-контейнеризированный конвейер для интерпретации соматических вариантов в онкологических панелях. Основная проблема, которую решает инструмент, заключается в непоследовательной приоритизации транскриптов и сложности интеграции доказательной базы OncoKB в воспроизводимые исследовательские процессы. Методология SMART включает объединение данных из VEP, CIViC, Cancer Hotspots, ClinVar, SpliceAI, REVEL, LOEUF и gnomAD с применением единой трехступенчатой системы приоритизации транскриптов (whitelist > MANE Select > VEP fallback). Инструмент интегрирует уровни доказательности OncoKB (терапевтические, резистентность, диагностические, прогностические и уровни FDA) непосредственно в VCF-рабочий процесс. Валидация системы показала полную согласованность (100% совпадение) по 804 проверкам на уровне полей при сравнении с эталонными API. SMART генерирует три типа выходных данных, адаптированных для вычислительных, биоинформатических и исследовательских задач, что значительно ускоряет процесс интерпретации геномных данных в онкологии.