Исследование представляет Hyper3D-lite — специализированный инструмент для аудита представления данных при анализе трехмерной структуры генома на основе технологий секвенирования длинных чтений (Oxford Nanopore, PacBio HiFi). Основная проблема, решаемая инструментом, заключается в искажении статистической значимости контактов: при стандартном попарном проецировании одна многоконтактная молекула может раздуваться до множества записей, создавая ложное впечатление избыточности биологических сигналов. Hyper3D-lite использует метод CPB (count-preserving statistical accounting) для обеспечения строгого статистического учета, сохраняющего исходное количество молекул. Методология позволяет сравнивать результаты стандартных проекций с консервативными оценками, отделяя широкомасштабные программные выводы от высокоточных кандидатов на высшие порядки контактов. Это критически важно для точной интерпретации хроматиновых конфигураций в геномике. Применение инструмента минимизирует риск ложноположительных результатов при анализе сложных многоконтактных взаимодействий в геноме.