Исследователи разработали ChemoCalib — новый фреймворк на основе многоблочного метода частичных наименьших квадратов (MB-PLS) для калибровки геномных метаболических моделей (GEMs). Метод интегрирует данные метаболомики, транскриптомики и протеомики, используя их совместную латентную структуру для калибровки границ реакций в моделях, что преодолевает ограничения традиционных подходов (E-Flux, GIMME, iMAT), работающих только с экспрессией генов. На 11 референсных условиях E. coli с данными 13C-MFA из наборов Keio fluxome и Holm 2010 модель iJO1366 с калибровкой ChemoCalib достигла коэффициента корреляции Спирмена ρ = 0,461 в целом (до 0,523 в пентозофосфатном пути) и Пирсона r = 0,49–0,58 для центральных углеродных путей. Статистически значимое улучшение по сравнению с базовыми методами E-Flux2 и SPOT подтверждено (p < 0,05 с поправкой Холма). Алгоритм использует GPR-aware VIP-агрегацию для проекции многоомиксных латентных оценок на границы реакций без эвристического порогования. Инструмент открыт (лицензия MIT), доступен с Docker-поддержкой и включает 5-минутный туториал, что делает его применимым для исследований метаболизма при заболеваниях и разработки лекарств, хотя текущая валидация проведена на бактериальных моделях.