Исследование представляет VIP2B — инновационный аналитический фреймворк, использующий теги рестрикции IIB типа для извлечения детальных характеристик вирусов (таксономия, покрытие, функции и фенотип) напрямую из данных полногеномного метагеномного секвенирования (WMS). Авторы доказали, что стандартные метагеномы содержат богатую вирусную информацию, сопоставимую по точности с обогащенными образцами вирусно-подобных частиц (VLP). При анализе 20 клинических когорт было установлено, что учет вирусных признаков позволяет выявлять специфические биомаркеры заболеваний, которые не обнаруживаются при анализе только бактериального компонента. Это значительно повышает точность диагностических моделей. Кроме того, на выборке из 6 090 человек были определены два различных состояния сообщества вирома кишечника, связанных с различными профилями здоровья. Работа закладывает методологическую основу для перехода к мульти-царственному анализу микробиома в клинической практике.