генная терапия

Стартап Life Biosciences, сооснователем которого является известный гарвардский биолог Дэвид Синклер, объявил о привлечении значительного финансирования в размере 80 миллионов долларов. Эти средства будут направлены на проведение клинических испытаний инновационной генной терапии, целью которой является «перепрограммирование» стареющих клеток для восстановления их функциональности. Методология исследования базируется на технологиях омоложения клеток, направленных на борьбу с возрастными заболеваниями на молекулярном уровне. Проект представляет собой попытку создать однократное терапевтическое вмешательство, способное замедлить или обратить вспять биологические процессы старения. Успех данных испытаний может радикально изменить подходы к лечению дегенеративных состояний, связанных с возрастом. Полученные инвестиции подтверждают высокий рыночный интерес к биомедицинским технологиям, использующим передовые методы генетической инженерии.

Исследование представляет FoundedPBI — ансамблевый подход глубокого обучения для предсказания взаимодействий бактериофагов с бактериями на основе ДНК-последовательностей. Методология использует ансамбль из трёх современных ДНК-языковых моделей (Nucleotide Transformer v2, DNABERT-2, MegaDNA), обученных на прокариотических и бактериофаговых геномах, с агрегацией выходов в единый мета-эмбеддинг и последующей классификацией нейросетью. Ключевые результаты: на бенчмарке PredPHI модель достигла F1-оценки 76%, превзойдя текущий state-of-the-art PBIP на 7%, а на внутреннем наборе данных CI4CB — 93% F1-оценка, улучшив предыдущие методы на 4%. Особый вклад — адаптация стратегий агрегации контекста NLP для обработки целых бактериальных и фаговых геномов до 5 млн пар оснований, что в 50-100 раз превышает контекстные окна фундаментальных моделей (12-96K bp). Это критически важно для ускорения открытия пар фаг-бактерия, необходимых для фаговой терапии как альтернативы антибиотикам. Практическая значимость: метод снижает трудоёмкость экспериментального скрининга, позволяя предсказывать совместимость пар по ДНК-последовательностям без лабораторных тестов, что может революционизировать разработку персонализированных фаговых препаратов.