Исследование посвящено изучению роли белка TDP-43, который играет ключевую роль в развитии рака и нейродегенеративных заболеваний. Ученые исследовали механизмы транскрипционной регуляции, используя мультиомиксные данные (Hi-C, ChIP-seq, RNA-seq, ATAC-seq) на клеточных линиях K562 и HepG2. Было установлено, что связывание TDP-43 тесно коррелирует с образованием структур ДНК G-квадруплексов (dG4) в ключевых точках анкеровки хроматиновых петель, таких как промоторы и энхансеры. Результаты показывают, что присутствие TDP-43 повышает стабильность dG4, увеличивает частоту взаимодействий хроматиновых петель и доступность хроматина, что ведет к активации экспрессии генов. Эксперименты по нокдауну TDP-43 в клетках HepG2 подтвердили, что снижение уровня белка приводит к значительному уменьшению формирования dG4 и ослаблению силы петлевых взаимодействий, вызывая масштабную транскрипционную дисрегуляцию. Данное открытие раскрывает новый молекулярный механизм, объясняющий, как нарушения в работе TDP-43 приводят к патологическим изменениям в экспрессии генов при различных заболеваниях.