В исследовании представлен новый вычислительный фреймворк для пространственного вывода регуляторных программ, предназначенный для глубокого анализа меланомы. Авторы решают проблему разделения данных: пространственная транскриптомика (ST) дает информацию об архитектуре ткани, но не о регуляции, а мультиомные методы на уровне единичных клеток не сохраняют пространственный контекст. Предложенный метод интегрирует данные Visium ST с данными single-cell multiome, используя пространственно-регуляризованное картирование «клетка-пятно» (cell-to-spot mapping) на базе алгоритма GraphST. В ходе работы исследователи успешно перенесли данные о доступности хроматина и активности мотивов транскрипционных факторов непосредственно в тканевое пространство. Применение фреймворка к образцам меланомы позволило выявить локализованные в пространстве регуляторные программы, которые ранее были недоступны. Результаты показывают, что стратегия назначения клеток критически влияет на стабильность последующего регуляторного анализа. Данный модульный подход обеспечивает интерпретируемые данные на уровнях генов, пиков и транскрипционных факторов, что имеет высокую значимость для точной диагностики и понимания микроокружения опухоли.