В данном исследовании рассматриваются подходы к интерпретации экспрессии генов для определения клеточной идентичности и активных молекулярных программ. Авторы фокусируются на микроглии — типе клеток, характеризующемся высокой транскриптомной, функциональной и морфологической гетерогенностью. В работе проводится сравнительный анализ двух методов анализа единичных клеток: дифференциальной экспрессии (для определения идентичности) и анализа сетей коэкспрессии (для выявления молекулярных программ). Результаты показывают, что анализ сетей коэкспрессии позволяет идентифицировать высокозначимые функциональные онтологии, которые не обнаруживаются при стандартном анализе дифференциальной экспрессии. Выявленные модули коэкспрессии сохраняются в различных транскриптомных наборах данных, что указывает на существование сократимых функциональных программ, активирующихся в зависимости от контекста. Исследование обосновывает использование анализа коэкспрессии как наиболее эффективного метода для описания функций микроглии через модель параллельных молекулярных программ.