Исследователи представили DBayesCM — новую глубокую байесовскую модель для кластеризации и анализа взаимосвязей в микробиомных мульти-омикс данных. Модель сочетает глубокое обучение с байесовскими непараметрическими методами: отдельные энкодеры проецируют данные микробиома и хозяина в общее латентное пространство, где бесконечная смесь моделей с приором Дирихле автоматически определяет количество кластеров и квантует неопределённость назначения каждого образца. Авторы оценили две версии модели: DBayesCM-vMF с гиперсферическим латентным пространством и DBayesCM-GMM с евклидовым пространством. На симулированных данных гиперсферальный вариант корректно восстановил число кластеров, тогда как евклидовый допустил избыточную сегментацию, что демонстрирует влияние геометрии латентного пространства на качество кластеризации. Модель протестирована на когортах пациентов с раком толстой кишки, молочной железы и почек, включая метаболомику хозяина, RNA-seq и miRNA данные, а также на модели обструктивного апноэ сна. DBayesCM выявляет условные вероятностные совпадения между ключевыми видами микробов и омикс-признаками хозяина, обеспечивая осознанное исследование взаимосвязей микробиом-хозяин при различных заболеваниях с учётом неопределённости.