В исследовании представлен HORI-EN — обновленный программный инструмент, предназначенный для глубокого анализа стабильности белков и их кооперативных сетей взаимодействий. Методология сочетает гибридное энергетическое скорирование (физико-химические и знания-ориентированные методы) с использованием нормализованного показателя взаимодействия (NIS) на основе функций кумулятивного распределения. В ходе валидации на наборе данных SKEMPI v2 инструмент продемонстрировал высокую точность в определении мутационных «горячих точек» (hotspots), показав ROC-AUC 0,780 на полном наборе и 0,844 на очищенном бенчмарке. Анализ обогащения показал 3,1-кратное увеличение точности для топ-1% прогнозов, а анализ сетей взаимодействий позволил восстановить 77,4% неконтактных горячих точек через идентификацию одношаговых связующих взаимодействий. Помимо прогнозирования мутаций, HORI-EN эффективно отличает нативные структуры от декой-моделей и выявляет консервативные энергетические сигнатуры в эволюционных исследованиях сериновых протеаз и липаз. Инструмент доступен в виде веб-сервера и открытого исходного кода, что делает его ценным ресурсом для вычислительной биологии и дизайна белков.