пептиды

Исследование представляет PatchMAN2 — улучшенную версию вычислительного протокола для докинга пептидов к белкам, который решает задачу поиска связывающих сайтов и конформаций пептидов. Методология основана на биомеханическом подходе, рассматривающем докинг как проблему фолдинга белка, с использованием структурных мотивов из решённых структур в качестве шаблонов, которые затем уточняются с помощью Rosetta FlexPepDock. Ключевые инновации PatchMAN2 включают стратегическую фильтрацию фрагментов и локальные режимы докинга, которые фокусируют поиск на релевантных поверхностях или известных связывающих регионах. Бенчмаркинг показал, что PatchMAN2 удаляет 30-70% ненужных фрагментов при сохранении точности, что существенно сокращает время вычислений и повышает практическую эффективность докинга пептид-белковых взаимодействий. Это критически важно для разработки лекарств, так как пептид-белковые взаимодействия часто являются транзиторными и структурно неуловимыми, требуя вычислительных подходов для их идентификации. Результаты делают метод более практичным для рутинного использования в исследовательских и фармацевтических лабораториях.

Биотехнологическая компания Pinnacle Medicines привлекла $89 млн в рамках раунда финансирования серии B от инвесторов из США и Китая, включая OrbiMed, LAV, Foresite Capital и других. Общий объём привлечённого капитала достиг $134 млн с момента основания в 2024 году. Средства будут направлены на перевод доклинического пайплайна в ранние клинические испытания, а также на продолжение исследований и разработок. Компания использует собственную платформу, которая интегрирует технологии искусственного интеллекта с физическими симуляциями для рационального дизайна и оптимизации пептидных терапевтических средств. Первоначальный фокус будет на иммунологии и кардиометаболических показаниях. Соучредитель и научный директор Чэнзао Сун подчёркивает, что быстрый прогресс пайплайна отражает эффективность этого подхода. Пероральные формы пептидов, включая GLP-1 агонисты, стали горячей темой: Novo Nordisk запустила пероральную форму Wegovy, Merck лицензировала платформу Cyprumed за $493 млн, а Protagonist Therapeutics номинировала перорального кандидата на ожирение в июне 2025 года.