Исследование представляет EcoXAI — инновационную модульную многоагентную систему, разработанную для преодоления сложностей при анализе гетерогенных биомедицинских данных и графов знаний. В отличие от традиционных монолитных LLM-интерфейсов, EcoXAI использует контейнеризированную архитектуру специализированных биоинформатических агентов, что минимизирует риск галлюцинаций и обеспечивает проверяемость каждого этапа анализа. Методология системы базируется на интеграции современных методов управления агентами (agentic management) и явном использовании графов знаний для обоснования выводов. В ходе практического применения системы для поиска новых мишеней при болезни Альцгеймера, EcoXAI проанализировала 103 потенциальных лекарственных препарата. В результате было выявлено 79 новых кандидатов, чьи прогнозные модели превзошли случайный базовый уровень. Одним из ключевых успехов стало обнаружение антагониста CCR5 — препарата Маравирок, гипотеза о применении которого была впоследствии подтверждена научной литературой. Данная разработка значительно ускоряет процесс формирования гипотез в трансляционных исследованиях, снижая вычислительный порог для клиницистов.