В исследовании представлен новый единый референсный ландшафт рака легких, построенный на основе анализа необработанных данных секвенирования РНК (RNA-seq) 1558 опухолей. Исследователи проанализировали широкий спектр патологий, включая аденокарциному (n=753), плоскоклеточный рак (n=540), мелкоклеточный рак легких (n=150) и неклассифицированный немелкоклеточный рак (n=80). С использованием алгоритма PaCMAP для эмбеддинга данных была создана непрерывная молекулярная карта, которая позволила отойти от жесткого разделения по гистологии в пользу транскрипционных осей. В результате консенсусной кластеризации было выявлено девять устойчивых молекулярных кластеров, включая специфическую подгруппу аденокарциномы (обогащенную среди женщин и некурящих) и нейроэндокринно-подобную аденокарциному с активацией ASCL1. Работа демонстрирует, что опухоли организованы по биологическим программам (пролиферативным, метаболическим и иммунным состояниям), что позволяет выявлять специфические уязвимости для таргетной терапии. Проекция опухолей пациентов и ксенографтов (PDX) на этот атлас подтвердила точность модели и открывает новые возможности для персонализированной онкологии.