Исследование оценивает пять методов вывода локальной родословной (local ancestry inference), включая две вероятностные базовые модели, RFMix, FLARE и свёрточную нейронную сеть с дилатацией, на данных с различной генетической дивергенцией (FST от 0.0022 до 0.243). Выявлено три ключевых результата: во-первых, существует порог осуществимости — при FST=0.0022 ни один метод не превышает точность 0.575, а для пары CHB/CHS при FST=0.00042 максимум составляет 0.551, что делает невозможным тонкий анализ близкородственных популяций. Во-вторых, точность на уровне отдельных позиций скрывает структурные ошибки: наиболее точный метод генерирует в 78.8 раз больше трактов, чем должно быть, что приводит к оценке времени адмиксации в 61.2 раз древнее реального, однако Viterbi-декодирование устраняет эту проблему без потери точности. В-третьих, превосходство методов на симулированных данных не воспроизводится на реальных данных 1000 Genomes, и основной лимитирующий фактор — не архитектура модели (внимание, state-space слои, предобучение дают прирост не более 0.006), а качество входных данных и размер референсной панели (добавление гаплотипной информации даёт +0.031 на 8 из 8 пар при FST<0.04). Работа имеет значение для генетических исследований заболеваний и персонализированной медицины, поскольку точный вывод родословной критичен для admixture mapping и ancestry-specific association testing.