Исследователи создали Celiac Microbiome Repository (CMR) — кураторскую открытую коллекцию данных секвенирования микробиома кишечника при целиакии. Цель проекта — решить проблему фрагментированности и гетерогенности данных, которые ранее были разбросаны по NCBI Sequence Read Archive (SRA) и Scopus. В CMR версии 1.0 включено 28 наборов данных, содержащих 3 245 образцов от пациентов из 13 стран, отобранных из 5 различных локаций тела. Все 16S данные были повторно обработаны через DADA2, а shotgun-данные — через MetaPhlAn4 для обеспечения сравнимости между исследованиями. Анализ показал, что хотя публичные образцы микробиома при целиакии накапливаются со скоростью примерно 140 в год, существуют значительные барьеры доступности: лишь 20 из 58 подходящих наборов данных имели как сырые данные, так и необходимую метаданную в публичных архивах. Ресурс имеет двухуровневую архитектуру с GitHub-бэкендом для программатического доступа и R Shiny-фронтендом для интерактивного исследования данных. Ключевая значимость работы заключается в создании инфраструктуры, которая позволяет исследовательскому сообществу проводить глобальные мета-анализы и применять методы машинного обучения для выявления новых биомаркеров и паттернов микробиома при целиакии, что в перспективе может улучшить диагностику и персонализированный подход к лечению.