В исследовании представлен новый математический фреймворк — иерархия миноров Лапласа, предназначенный для количественной оценки сложных многочастичных взаимодействий, определяющих аллостерию в белковых сетях. Авторы разработали систему топологических мер, где миноры низшего порядка дают стандартные метрики, а миноры высших порядков позволяют вычислять индексы кооперации (от 0 до 1). Третий порядок минора определяет корреляцию аллостерических путей, а четвертый — степень коммуникации между путями через промежуточные остатки. На примере домена PSD95pdz3 была проанализирована эволюционная адаптация специфичности лигандов при мутациях G330T и H372A. Результаты показали, что мутация G330T создает распределенные связи, которые затем использует мутация H372A, при этом четвертый порядок анализа выявил His317 как критический узел, связывающий пути переключения классов. Данный метод позволяет не просто предсказывать механизмы, а объяснять, как именно аллостерические зависимости возникают в процессе эволюции белков.