102 статей
Исследование оценивает применение LLM для анализа структурированных клинических данных, показывая, что LLM-эмбеддинги могут сохранять структурную целостность клинических наборов данных и улучшать предиктивное моделирование. Тестирование на синтетических и реальных клинических данных (база UCI, пациенты с эндокардитом) продемонстрировало высокую точность (cosine similarity до 0.95) и улучшенные предиктивные характеристики.
Исследователи представили ClumPyCells — новый статистический фреймворк для анализа пространственной организации клеток в тканях с коррекцией на морфологические различия. Ключевая проблема, которую решает инструмент: различия в размерах клеток вводят значительные смещения при количественной оценке агрегации клеток или их молекулярных признаков, что может приводить к ошибочным интерпретациям данных пространственной транскриптомики и протеомики. Методология включает алгоритмы, позволяющие измерять агрегацию клеток и маркеров в ткани, одновременно корректируя влияние размера морфологии и исключая мешающие типы клеток или не связанные с исследованием области ткани. Валидация проводилась на нескольких типах опухолей, включая меланому и колоректальный рак, демонстрируя способность инструмента выявлять новые паттерны и структуры ткани без морфологических помех. Это имеет практическое значение для онкологических исследований, где точное понимание пространственной организации клеток критично для понимания развития опухоли, гомеостаза и патогенеза заболеваний. Инструмент позволяет исследователям интерпретировать пространственную агрегацию, обходя помехи от интерферирующих типов клеток.
