Исследователи разработали автоматизированный программный инструмент для курации данных в геномике, который заменяет ручной труд человека при аннотировании транскриптомных исследований. Система используется для ресурса Gemma — вручную курируемой базы данных, включающей более 23 000 наборов данных человека, мыши и крысы, преимущественно из Gene Expression Omnibus (GEO). Пайплайн сочетает традиционные механические методы и большие языковые модели для создания детальных аннотаций на уровне образцов и экспериментов с привязкой к онтологиям. Бенчмаркинг показал, что производительность системы близка к уровню человеческих кураторов, при этом стоимость снижена в 20 раз, а скорость увеличена минимум в 100 раз. Авторы также представили предварительные методы триажа для выявления ошибок в автоматических курациях с последующей передачей на человеческую проверку. В качестве дополнительных результатов предоставлены бенчмарк-набор из 500 исследований и框架 оценки для дальнейшего развития пайплайна. Данное решение имеет значительный потенциал для интеграции в биоинформатические экосистемы и ускорения медицинских исследований на основе геномных данных.