В статье представлен ARACRA — инновационный полностью автоматизированный конвейер (pipeline) для анализа данных РНК-секвенирования, предназначенный для упрощения процесса биоинформатической обработки. Система охватывает весь рабочий процесс: от обработки необработанных FASTQ-файлов до определения транскриптомной точки отсчета (tPoD) с использованием механизма контроля «человек в цикле» (human-in-the-loop). Процесс разделен на два ключевых этапа: первый включает контроль качества, выравнивание на референсный геном и квантификацию экспрессии генов, а второй — статистический анализ дифференциальной экспрессии и моделирование зависимости «доза-эффект». Инструмент реализован в виде интерактивного веб-приложения на базе Nextflow и Streamlit, что значительно снижает вычислительную сложность для биологов. ARACRA позволяет исследователям проводить сквозной анализ, визуально инспектировать данные для фильтрации шума и выбросов, а также использовать собственные наборы данных. Программное обеспечение доступно бесплатно под лицензией MIT на GitHub, что делает его ценным ресурсом для токсикологии и оценки рисков.